Het kerkgebouw is in 1885 gebouwd naar ontwerp van Nicolaas Molenaar, leerling van de bekende architect P.J.H. Cuypers. In 1935 is het kerkgebouw uitgebreid met twee zijbeuken, ontworpen door de zoon van de architect die het oorspronkelijke ontwerp maakte, Nicolaas Molenaar jr. In de jaren na de oorlog werd de kerk door diverse kunstenaars verfraaid. Zo kwam er in 1948 een nieuw Caecilia-raam vervaardigd door Max Weiss uit Roermond, en werden er nieuwe beelden geplaatst. In datzelfde jaar werden ook nieuwe kerkklokken opgehangen in de kerktoren.
In 1972 werd de kerk gerestaureerd. De inrichting werd soberder gemaakt. De muren werden wit overgeschilderd, over de muurschilderingen heen. In de orgelkas zijn nog fragmenten van muurschilderingen te zien. In 1997 werden de buitenkant van de kerktoren, en het Ceacilia-raam gerestaureerd. In 2005 volgden de buitenkant van de kerk en de pastorie.
Het eerst orgel voor de Sint-Willibrorduskerk wordt in 1897 wordt nieuw geleverd door Maarschalkerweerd & Zoon. In 1962 wordt het vervangen door het huidige orgel van Vermeulen (Alkmaar). Het instrument staat opgesteld in twee kassen die het Caecilia-raam zichtbaar houden. Het is (nog) niet duidelijk waar het Maarschalkerweerd orgel is gebleven.
Het Vermeulen-orgel is vanaf 1997 niet of nauwelijks gebruikt. Vanaf eind 2006 werd het instrument door mij gerestaureerd. Om budgettaire redenen werd dit werk in verschillende fasen uitgevoerd.